Melanoma predisposition genes in the Latvian population

Abstract

Ādas melanoma ir ļaundabīgākais ādas audzējs. Darba mērķis bija izvērtēt augsta, vidēja un zema melanomas riska gēnu ietekmi uz melanomas attīstību un izdzīvotību Latvijas populācijā. Pirmo reizi Latvijā atrasts CDKN2A variants, kas saistīts ar melanomas attīstību. Atrasta trešā ģimene Latvijā ar atkārtotiem melanomas saslimšanas gadījumiem un variantu p.Arg24His CDK4 gēnā. Galvenais riska variants sporādiskajiem melanomas pacientiem Latvijā ir vidēja riska gēna MC1R variants p.Arg151Cys. Melanomas risks ir atkarīgs no MC1R variantu skaita, un to veidotais risks ir neatkarīgs no pigmentācijas fenotipa. Vidēja un zema melanomas riska gēnu MITF, TP53 un MDM2 variantiem ir maza ietekme uz melanomas attīstību Latvijā, bet PARP1 variants rs2249844 ir saistīts ar paaugstinātu nāves risku. Atslēgas vārdi: melanoma, ģenētiskās izmaiņas -

Cutaneous melanoma is the most malignant skin cancer. Study aim was to investigate the role of high, medium and low melanoma risk genes in melanoma development and survival in the Latvian population. For the first time in Latvia melanoma associated variant in CDKN2A gene was found. The third Latvian CDK4 melanoma family with variant p.Arg24His was identified. The main risk variant in Latvian sporadic melanoma patients is medium melanoma risk gene MC1R variant p.Arg151Cys. Melanoma risk depends on number of MC1R variants, and the risk associated with them is independent from pigmentation phenotype. Variants in medium and low melanoma risk genes MITF, TP53, and MDM2 have a minor effect on melanoma development in Latvia, but PARP1 variant rs2249844 is associated with an increased risk of death. Key-words: melanoma, genetic variants