METFORMIN EFFECTS ON GUT MICROBIOME AND EPIGENETICS IN TYPE 2 DIABETES PATIENTS AND HEALTHY INDIVIDUALS
Autor
Elbere, Ilze
Co-author
Latvijas Universitāte. Bioloģijas fakultāte
Advisor
Kloviņš, Jānis
Datum
2021Metadata
Zur LanganzeigeZusammenfassung
Metformīna farmakodinamika ir plaši pētīta, tomēr detaļas joprojām ir neskaidras. Šī pētījuma mērķis bija identificēt taksonomiskos un funkcionālos zarnu mikrobioma biomarķierus, kā arī saimniekorganisma epiģenētiskās iezīmes metformīna farmakodinamikai, terapijas efektivitātei un tolerancei. Izmantojot zarnu mikrobioma lielapjoma paralēlo sekvenēšanu, mēs novērojām metformīna terapijas izraisītu būtisku un tūlītēju iekšējās daudzveidības samazināšanos, kā arī taksonomiskā profila izmaiņas jaundiagnosticētiem T2D pacientiem un veseliem indivīdiem. Mēs prezentējām pirmsterapijas mikrobioma taksonomisko sastāvu kā rīku terapijas efektivitātes un tolerances prognozēšanai. Dati par globālajām DNS metilēšanas izmaiņām metformīna lietošanas laikā parādīja pirmo un pašlaik vienīgo pētījumu, kurā analizēta longitudināla ietekme veselos indivīdos. The pharmacodynamic effects of the metformin have been widely studied, yet details remain obscure. The aim of this study was to identify taxonomic and functional gut microbiome biomarkers as well as epigenetic signatures of the host for metformin pharmacodynamics, therapy efficacy and tolerance. Using massive parallel sequencing of gut microbiome, we observed significant and immediate reduction of inner diversity and changes in the taxonomic profile caused by metformin in newly diagnosed T2D patients and healthy individuals. We also presented the baseline sample composition as a prediction tool for therapy efficacy and tolerance. Study on global DNA methylation changes during metformin use presented the first and currently the only study evaluating longitudinal effects in peripheral blood cells of healthy individuals.