SARS-CoV-2 infekcija COVID-19 pacientiem Latvijā

Abstract

Šī darba ietvaros tika pētīta SARS-CoV-2 infekcija COVID-19 pacientiem Latvijā, raksturojot vīrusa genoma klātbūtni un slodzi vairākos klīniskajos paraugos un antivielas dinamikā. Pētījumā iesaistīti 134 pacienti, kuriem bija detektēts SARS-CoV-2 RNS nazofaringeālājās iztriepēs ar RT-PĶR metodi, pirms hospitalizācijas. Tika ievākti COVID-19 pacientu nazofaringeālās iztriepes, fēces, urīns, asins plazma, PMBC SARS-CoV-2 genoma klātbūtnes un vīrusa slodzes noteikšanai, izmantojot RT-kPĶŖ metodi. Tika ievākti pacientu plazmas paraugi antivielu detektēšanai un raksturošanai dinamikā, izmantojot ELISA metodi. SARS-CoV-2 genoma sekvence visbiežāk tika detektēta nazofaringeālajās iztriepēs (100/134, 74,6%) un fēcēs (76/104, 73,1%). Visaugstākā mediānā slodze tika konstatēta fēču paraugos (14529 [IQR 3224 – 93704] kopijas/ml). IgM antivielu titrs sāk samazināties pēc 12 dienām, un IgG titrs augstā līmenī spēj saglabāties līdz 119 dienām.

The aim of this study was to evaluate SARS-CoV-2 infection in COVID-19 patients in Latvia, exploring the presence of SARS-CoV-2 and viral load in various clinical specimens and evaluating antibody response to SARS-CoV-2 in dynamics. Nasopharyngeal swabs, faeces, urine, blood plasma and PBMC samples from COVID-19 patients were collected to detect SARS-CoV-2 genome and viral load, using the RT-qPCR method. Patient plasma samples were collected for antibody detection and analysis in dynamics, using ELISA method. SARS-CoV-2 was detected most frequently in nasopharyngeal swab (100/134, 74,6%) and fecal (76/104, 73,1%) samples. The highest median load was observed in faecal samples (14529 [IQR 3224 - 93704] copies/ml). IgM class antibody titers decreased after 12 days, and IgG titer maintained at high level for up to 119 days.