Aizkuņģa dziedzera neiroendokrīno neoplazmu transkriptoma profila izpēte

Abstract

Aizkuņģa dziedzera neiroendokrīno neoplazmu (PanNEN) transkriptoma pētījumi var palīdzēt izprast PanNEN molekulāro profilu un to ietekmējošos faktorus. Šī darba ietvaros tika veikta transkriptoma sekvencēšana aizkuņģa dziedzera neiroendokrīno audzēju (PanNET), audzējam blakus esošo aizkuņģa dziedzera un metastāžu audu formalīnā fiksētiem un parafīnā ieslēgtiem (FFPE) paraugiem ar mērķi identificēt jaunus neinvazīvus molekulāros marķierus. PanNET kandidātmarķieri LAMA4, CTRB2, CPA1, CPB1, REG1A, REG1B un PRSS1 var tikt potenciāli izmantoti neinvazīvai PanNET diagnostikai. Turklāt metastāžu veidošanos galvenokārt sekmē angioģenēzi un šūnu migrāciju aktivējoši signālceļi. Darba ietvaros tika veikta arī aizkuņģa dziedzera neiroendokrīno karcinomu (PanNEC) ksenograftu audu paraugu transkriptoma sekvencēšana ar mērķi izpētīt platīna bāzes ķīmijterapijas medikamentu – etopozīda un cisplatīna – kombināciju un jauna medikamenta alisertība ietekmi uz PanNEC transkriptoma profilu. Etopozīda/cisplatīna terapija būtiski kavē PanNEC progresiju transkriptoma līmenī, taču alisertībs neuzrādīja pārliecinošu efektu pētītajā in vivo modelī. Atslēgas vārdi: PanNEN, PanNET, PanNEC, diferenciālā gēnu ekspresija, transkriptoms, medikamentozā terapija, biomarķieri.

Transcriptome studies of pancreatic neuroendocrine neoplasms (PanNENs) can help understand the molecular profile of PanNENs and give insight into influencing factors. As part of this work, transcriptome sequencing was performed for formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) samples of pancreatic neuroendocrine tumour (PanNET), adjacent pancreatic, and metastatic tissues to identify new non-invasive molecular markers. PanNET candidate markers LAMA4, CTRB2, CPA1, CPB1, REG1A, REG1B, and PRSS1 may be potentially used for non-invasive diagnosis of PanNETs. Additionally, signalling pathways that activate angiogenesis and cell migration promote PanNET metastasis. Furthermore, transcriptome sequencing for tissue samples of pancreatic neuroendocrine carcinoma (PanNEC) xenografts was also performed with the aim to investigate the effect of the combination of platinum-based chemotherapy medications – etoposide and cisplatin –, and the new medical agent alisertib on the transcriptome profile of PanNEC. Etoposide/cisplatin therapy significantly inhibits the progression of PanNEC at the transcriptomic level, whereas the effects of alisertib were contentious within the studied in vivo model.