Izmaiņas asins šūnu transkriptomā pacientiem ar ilgstošām Covid-19 komplikācijām

Abstract

SARS-CoV-2 vīruss ir bīstama infekcija, pēc kuras daudzi cilvēki joprojām cieš no ilgstošiem simptomiem un komplikācijām. Molekulārie mehānismi ilgstošu komplikāciju attīstībā ir neskaidri un tas apgrūtina pacientu ārstēšanu, tāpēc tie jāturpina pētīt. Darbā veikta stacionēto cilvēku transkriptoma analīze, salīdzinot akūtās fāzes paraugus pret paraugiem atveseļošanās fāzē mēnesi un 3 mēnešus pēc stacionēšanas. Rezultātā tika noteiktas būtiskas ekspresēto gēnu izmaiņas, kā arī konstatētas izmaiņas vairākos KEGG signālceļos, tai skaitā, neitrofilu ārpusšūnu slazdu (NET) veidošanās, dažādu neirodeģeneratīvo slimību signālceļi, tika konstatētas arī izmaiņas oksidatīvās fosforilēšanās procesā un citos metabolisma signālceļos. Uz transkriptoma datiem balstīta signālceļu izpēte var sniegt zināšanas par potenciālajiem terapeitiskajiem mērķiem.

After SARS-CoV-2 infection many people suffer from long-term symptoms and complications. Molecular mechanisms in the development of long-term complications are unclear and this makes it difficult to treat patients, so they should be further studied. Transcriptome analysis of inpatients was performed in the work, comparing acute phase samples against samples in the recovery phase for a month and 3 months after hospitalization. As a result, significant changes in the expressed genes, as well as changes in several KEGG signaling pathways were detected, including the formation of neutrophil extracellular traps (NET), signaling pathways of various neurodegenerative diseases, changes in oxidative phosphorylation. Research into signaling pathways based on transcriptome data can provide knowledge of potential therapeutic targets.