Klīniskajā praksē lietoto epiģenētisko regulatoru ietekme uz hipofīzes audzēju primārajām šūnu kultūrām
Zusammenfassung
Hipofīzes neiroendokrīnie audzēji (PitNET) ir intrakraniālās labdabīgas neoplazmas, taču to ārstēšana rada lielu slogu veselības aprūpes sistēmām. Epiģenētiskajiem regulatoriem ir liels potenciāls uzlabot pašreizējo audzēju ārstēšanu, padarot audzēja šūnas jutīgākās pret tradicionālajām ārstēšanas terapijām un imūnterapijām. Darba ietvaros tika sagatavotas 52 transkriptoma bibliotēkas, kuras tālāk tika sekvencētas uz MGI platformas, izmantojot MGI DNBSEQTM sekvencēšanas tehnoloģiju. Tika novērtēta epiģenētisko regulatoru (nātrija butirāta un azacitidīna) ietekme uz hipofīzes audzēju primārajām šūnu kultūrām, kā arī analizēts to darbības mehānisms. Veicot diferenciālās ekspresijas analīzi un savstarpēji salīdzinot PitNET modeļkultūras, tika identificēti 18 statistiski būtiski DEG ar vislielākajām ekspresijas izmaiņām, bet kopumā tika identificēti 1448 DEG, kas būtiski mainās ekspresijā visos laika punktos. Pituitary neuroendocrine tumors (PitNETs) are intracranial benign neoplasms, but their treatment imposes a high burden on healthcare systems. Epigenetic regulators have great potential to improve current tumor treatment by resensitizing tumor cells to conventional treatment therapies and immunotherapies. As part of the work, 52 transcriptome libraries were prepared, which were further sequenced on the MGI platform using the MGI DNBSEQTM sequencing technology. The effect of epigenetic regulators (sodium butyrate and azacitidine) on primary cell cultures of pituitary tumors was evaluated, as well as their mechanism of action was analyzed. After performing differential expression analysis and comparison of model–cultures, we identified 18 statistically significant DEGs with the greatest changes in expression, but overall, we identified 1448 differentially expressed genes.